为了确保南沙与广州及珠江三角洲的紧密联系，南沙地区规划了以高、快速路为骨架，以铁路、地铁、航运为支撑的综合交通体系。

      在高、快速路网络方面，规划了京珠高速公路东线、广州南沙港快速路、东部快速干线、西部快速干线等5条南沙地区与广州联系的高、快速路，其中南沙港快速路从广州环城高速公路的仑头立交直达龙穴岛，将广州市区的大学、科研机构、科学城、大学城和南沙联系在一起。在铁路方面，规划了北接新京广铁路快线直达龙穴岛港区的疏港铁路。轨道交通方面，地铁3号线从番禺广场延伸到广州新城与地铁4号线交汇后延伸到南沙。

      连接港区与外界的第一座桥梁，新龙大桥已于2004年7月通车。直达南沙港区的广州南沙港快速路已于2005年1月1日 全线通车。连接南沙经济技术开发区的蒲洲大桥目前正在施工。

公路集疏运网络

      中山的货源：通过S111（省道）向东经（珠江管理区接口）连接南沙港快速路，经新龙大桥，到达南沙港区，运距63公里。

      顺德的货源：通过S362上S111或上南沙大道（鱼窝头接口）连接南沙港快速路，经新龙大桥，到达南沙港区，运距62公里。东莞西部地区的货源：通过虎门-京珠高速（横沥立交接口）和南沙港快速路连接，经新龙大桥，到达南沙港，运距60公里。 

      番禺的货源：通过南沙大道（鱼窝头接口）或经过S111（珠江管理区接口）连接南沙港快速路，经新龙大桥，到达南沙港港区，运距57公里。

      佛山（南海）的货源：通过G105国道向南和S362或者S257相连接，然后经S111（省道）或连接南沙港快速路，经新龙大桥，到达南沙港区，运距85公里。

出海航道：

      南沙港区水路距广州港新沙港区21海里,距深圳西部港区21海里,距桂山锚地35海里,距香港36海里,距广州市38海里;公路距广州市中心70公里。